早年為晉王楊廣的親信，升遷至監門校尉。煬帝繼位後，官至監門直閣、通議大夫。大業十四年（618年）三月，參與江都政變，跟元禮率軍攻擊東閣，再入西閣，縊殺隋煬帝。貞觀2年，唐太宗以裴虔通不忠於隋煬帝遷配懽州。

隋書宇文化及傳記載：「虔通因自開門，領數百騎，至成象殿，殺將軍獨孤盛。武賁郎將元禮遂引兵進，突衛者皆走。虔通進兵，排左閣，馳入永巷，問：『陛下安在？』有美人出，方指云：『在西閣。』從往執帝。帝謂虔通曰：『卿非我故人乎！何恨而反？』虔通曰：『臣不敢反，但將士思歸，奉陛下還京師耳。』」這是因為楊廣登基前，禮賢下士，與裴虔通親如兄弟，故有此言。

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