後秦建初元年（386年），姚萇稱帝，以姚緒為征虜將軍、司隸校尉，鎮守長安。八年（393年），姚萇死後，姚緒率軍鎮守安定。姚興即位，封姚緒為晉王，防禦東邊。姚緒受命從龍門進入蒲阪，擊敗西燕河東太守柳恭，拜并州冀州二州牧，鎮守蒲阪。弘始四年（402年）後秦徵發各軍伐北魏，姚緒受命河東兵為前軍節度，魏軍進攻蒲阪，他固守不戰。姚緒有政績，朝廷大事都先諮詢他再執行。後來官至丞相。弘始十四年（412年），姚興下詔讓姚緒與姚碩德、姚旻、尹緯、姚崇等二十四人配饗於姚萇太廟。